Clarendon Anayasaları: Henry II, 1164'te Clarendon Anayasaları olarak bilinen bir dizi yasa çıkardı. Bu yasalar, özellikle piskoposların atanması ve suçlarla suçlanan din adamlarının yargı yetkisi ile ilgili olarak İngiltere'deki Kilisenin gücünü ve ayrıcalıklarını sınırlamayı amaçlıyordu. Becket, Canterbury Başpiskoposu olarak, Kilise'nin özerkliğine tecavüz olduğu gerekçesiyle Anayasalara karşı çıktı.
Dini dokunulmazlık: Henry II, din adamları üzerindeki kontrolünü sağlamak ve onları kraliyet mahkemelerinin yetkisi altına almak istiyordu. Öte yandan Becket, kilisenin kendi işlerini yönetme hakkını savunarak din adamlarının yalnızca dini mahkemelere tabi olması gerektiğine inanıyordu.
Piskoposların atanması: Henry II, piskoposların atanmasında söz sahibi olmak, onların kendisine sadık olmalarını ve politikalarını desteklemelerini sağlamak istiyordu. Becket, piskoposların seçiminin kraliyet müdahalesi olmaksızın yalnızca dini değerlere dayanması gerektiğinde ısrar etti.
Yargı yetkisiyle ilgili anlaşmazlık: Philip de Brois adlı bir katip bir suçla itham edildiğinde ve hem kraliyet mahkemeleri hem de dini mahkeme tarafından hak iddia edildiğinde çatışma daha da arttı. Becket, bunun Kilise'nin yargı yetkisini ihlal ettiğini ileri sürerek katibi kraliyet mahkemelerine teslim etmeyi reddetti.
Henry II ile Becket arasındaki anlaşmazlık, monarşi ile Kilise arasında kontrol ve otorite konusunda daha geniş bir mücadeleyi simgeliyordu. Çatışma, Thomas Becket'in 1170 yılında Canterbury Katedrali'nde II. Henry'ye sadık şövalyeler tarafından öldürülmesiyle doruğa ulaştı. Becket'in öldürülmesi önemli bir tepkiye yol açtı ve sonunda II. Henry'nin taviz vermesine ve Kilise'nin ayrıcalıklarını ve bağımsızlığını yeniden onaylamasıyla sonuçlandı.