Émile Roux'un yaptığı önemli keşiflerden ve katkılardan bazıları şunlardır:
1. Difteri Toksini :Roux, Alexandre Yersin ile birlikte Corynebacterium diphtheriae bakterisini keşfetti. Difteri semptomlarından sorumlu olan bir toksin üretir. Bu keşif, hastalığın patogenezinin anlaşılmasında önemli bir atılımdı.
2. Difteri Antitoksini :Roux ve meslektaşı Pierre Paul Émile Roux ayrıca atlara toksin enjekte edilerek difteriye karşı bağışıklık kazandırılabileceğini gösterdi. Aşılanmış atlardan alınan serumun, toksini nötralize edebilecek ve difteri enfeksiyonuna karşı koruma sağlayabilecek antikorlar içerdiği bulundu. Bu, difteri için çığır açan bir tedavi olan ve hastalığın ölüm oranını önemli ölçüde azaltan difteri antitoksininin geliştirilmesine yol açtı.
3. Pastörizasyon :Roux, pastörizasyon konusundaki öncü çalışmalarıyla tanınan Louis Pasteur ile yakın çalıştı. Roux, pastörizasyonun pratik uygulamalarına önemli katkılarda bulunarak gıdaların korunmasında ve hastalıkların süt yoluyla bulaşmasının önlenmesinde etkinliğini gösterdi.
4. Roux-Chamberland Filtresi :Roux, meslektaşı Charles Chamberland ile birlikte, sıvılardan bakterileri ve diğer mikroorganizmaları uzaklaştırmak için kullanılan bir tür seramik filtre olan Roux-Chamberland filtresini geliştirdi. Bu filtre, mikrobiyolojik tekniklerde çok önemli bir rol oynadı ve mikroorganizmaların çalışma ve saflaştırma için ayrılmasını sağladı.
5. Pasteur Enstitüsü :Roux, Paris'teki ünlü bir araştırma kurumu olan Pasteur Enstitüsü'nün kuruluşunda ve gelişmesinde etkili bir rol oynadı. 1895'ten emekli olduğu 1933 yılına kadar enstitünün direktörlüğünü yaptı. Onun liderliğinde Pasteur Enstitüsü mikrobiyoloji, immünoloji ve diğer biyomedikal araştırmalar için önde gelen bir merkez haline geldi.
Roux'un keşifleri ve katkıları mikrobiyoloji alanını büyük ölçüde geliştirdi ve bulaşıcı hastalıkların önlenmesi ve tedavisinde derin bir etki yarattı. Bakteriyoloji ve immünoloji alanında öncü bir isim olarak hatırlanıyor ve çalışmaları tıbbi araştırma ve uygulamaları etkilemeye devam ediyor.