Ölümünün kesin nedeni bilinmiyor, ancak bir kalp krizi olduğuna inanılıyor Zorlu koşullar nedeniyle kalmıştı. Çadırının yakınında ölü bulundu ve vücudu bir kar yağışı altına gömüldü.
Wegener'in 1912'de önerdiği kıtasal sürüklenme teorisinin yaşamı boyunca yaygın olarak kabul edilmediğini belirtmek önemlidir. Nispeten bilinmeyen bir bilim adamı öldü, ancak çığır açan teorisi sonunda doğru kanıtlandı ve şimdi jeoloji tarihinin en önemli figürlerinden biri olarak kabul ediliyor.