Skillet'in baş vokalisti John Cooper bir röportajda şarkının arkasındaki ilhamı paylaştı. Yazma sürecinde kendisinin ve eşinin zor bir dönemden geçtiğinden bahsetti. Cesaretleri kırılmış hissediyorlardı ve öz değerlerini sorguluyorlardı. Şarkı bu duygulara bir yanıt olarak ortaya çıktı, onların doğuştan gelen değerlerini ve birbirlerine duydukları sevgiyi hatırlattı.
Cooper, benzer şüpheler veya güvensizlikler yaşayan diğer kişilerde yankı uyandıracak bir şarkı yaratmak istedi. Şarkının bireylere, kendileri her zaman böyle hissetmeseler bile, gerçek benliklerini kucaklamaları ve sevilip kabul edildiklerini hissetmeleri konusunda ilham vereceğini umuyordu.
"Hey Sen, Ruhunu Seviyorum" dinleyicilerin moralini yükseltmeyi ve güçlenme duygusu getirmeyi amaçlıyor. Kendine şefkati, kendini kabul etmeyi ve koşulları ne olursa olsun her bireyin sevgiye ve ait olmaya layık olduğu anlayışını teşvik eder.