Slayer'ın Hıristiyanlığı eleştiren şarkılarından bazıları arasında "Angel of Death", "South of Heaven" ve "Raining Blood" yer alıyor. Bu şarkılar Katolik Kilisesi'ni, İncil'i ve Tanrı kavramını eleştiren sözler içeriyor. Ancak, bu şarkıların kelimenin tam anlamıyla anlaşılmasının amaçlanmadığını ve bunların yalnızca bir sanatsal ifade biçimi olduğunu belirtmek önemlidir.
Slayer'ın müziği, şiddeti ve nefret söylemini teşvik ettiğine inanan bazı dini gruplar tarafından eleştirildi. Ancak grup, müziğini Amerika Birleşik Devletleri Anayasası'nın Birinci Değişikliği tarafından korunduğunu söyleyerek savundu.
Genel olarak Slayer, Hıristiyanlık karşıtı temaları nedeniyle eleştirilen tartışmalı bir gruptur. Ancak grup üyeleri Hıristiyanlık karşıtı olmadıklarını ve müziklerinin ciddiye alınmaması gerektiğini belirttiler.