• Brandenburg Konçertosu No. 2, Fa majör, BWV 1047:Bu konçerto, birinci ve üçüncü bölümlerde belirgin bir flüt parçasına sahiptir.
• Brandenburg Konçertosu No. 4, Sol majör, BWV 1049:Bu konçertonun ikinci bölümünde flüt solo bir rol oynuyor.
• Orkestra Süiti No. 2, Si minör, BWV 1067:Bu süitin "Badinerie" bölümünde flüt kullanılmıştır.
• La Majör Flüt Sonatı, BWV 1032:Bu sonat özellikle flüt ve klavsen veya sürekli için yazılmıştır.
• E minör Flüt ve Devamlı Sonat, BWV 1034:Bir devamlılık eşliğinde flüt içeren başka bir sonat.
• La minör Flüt için Partita, BWV 1013:Bu partita, flüt için yazılmış çeşitli dans hareketlerinden oluşur.
• Kantatlar:Bach, "Jauchzet Gott in allen Landen", BWV 51 ve "Ich armer Mensch, ich Sündenknecht," BWV 55 gibi bazı kilise kantatlarında flüt parçalarına da yer verdi.
Bunlar Bach'ın flüt için yazılmış müzikleri içeren bestelerinden sadece birkaç örnektir. Bach başlı başına özel bir flüt konçertosu yazmadı.