- Orkestra Müziği:
- Brandenburg Konçertosu (1721)
- Orkestra Süitleri (1720-1723)
- Keman Konçertosu (1717-1723)
- Klavye Müziği:
- İyi Temperlenmiş Klavye (1722, 1744)
- Goldberg Çeşitleri (1741)
- Fransız Süitleri (1722-1725)
- Buluşlar ve Sinfonialar (1723)
- Org Müziği:
- Re Minor'da Toccata ve Füg (c. 1703-1707)
- Do Minor'da Passacaglia ve Füg (c. 1708)
- Sol Majör Prelüd ve Füg (c. 1730-1735)
- Vokal Müziği:
- Aziz Matthew Tutkusu (1727)
- Aziz John Tutkusu (1724)
- Büyütme (1723)
- Noel Oratoryosu (1734-1735)
- Diğer Çalışmalar:
- Das Musikalische Opfer (Müzikal Sunu) (1747)
- Füg Sanatı (c. 1749-1750)
- Kantatlar (200'ün üzerinde)
- Kitleler (6)