* Piyano: Röportajlarında piyano çalmaktan bahsetti ve hatta bazı rollerinde piyano çaldı.
* Gitar: Bazı televizyon programlarında gitar çalarken görüldü ve hatta bir grupla sahneye çıktı.
* Davullar: Davul çalma becerilerini birkaç maçta sergiledi.
* Ukulele: Evinde bir ukulele var ve onu öğrenmeye ilgi gösterdi.
Neil Patrick Harris profesyonel bir müzisyen olmasa da eğlence için çeşitli enstrümanlar çalmaktan hoşlanıyor ve hatta bunları çalışmalarına dahil ediyor gibi görünüyor.