* Dağlar: İpek Yolu, aralarında Himalayalar, Karakoram ve Hindukuş'un da bulunduğu dünyanın en yüksek dağ sıralarından bazılarından geçiyordu. Bu dağlar genellikle kar ve buzla kaplı olduğundan seyahati zor ve tehlikeli hale getiriyordu.
* Çöller: İpek Yolu aynı zamanda Gobi Çölü ve Taklamakan Çölü de dahil olmak üzere dünyanın en kurak çöllerinden bazılarından geçiyordu. Bu çöller son derece sıcak ve kuruydu ve çoğu zaman su ve yiyecekten yoksundu.
* Nehirler: İpek Yolu, Ganj, İndus ve Fırat dahil olmak üzere birçok büyük nehirden geçiyordu. Bu nehirleri geçmek, özellikle muson mevsiminde genellikle zordu.
* Ormanlar: İpek Yolu ayrıca Orta Asya ormanları ve Güneydoğu Asya ormanları dahil olmak üzere bazı yoğun ormanlardan da geçiyordu. Bu ormanlar genellikle gezginler için tehlikeli olabilecek vahşi hayvanlara ev sahipliği yapıyordu.
Bu coğrafi özelliklere ek olarak İpek Yolu, eşkıyaların, soyguncuların ve diğer tehlikelerin varlığı nedeniyle de zorlaştı. Sonuç olarak İpek Yolu üzerindeki yolcular güvenlik nedeniyle sıklıkla büyük kervanlarla seyahat etmek zorunda kalıyordu.