Mikroskopinin babası, mikroskopi alanındaki öncü çalışmaları ve mikroorganizma keşifleriyle tanınan Hollandalı bir tüccar ve bilim adamı olan Anton van Leeuwenhoek'tur. Bakterileri, protozoaları, spermatozoaları ve diğer mikroskobik organizmaları gözlemleyen ve tanımlayan ilk kişi oydu. Leeuwenhoek, küçük cam küreleri taşlayıp parlatarak kendi mikroskoplarını yaptı ve bunları 270 kata kadar büyütme elde etmek için kullandı. Gözlemlerinin ayrıntılı çizimlerini ve açıklamalarını yaptı ve bunları Londra Kraliyet Cemiyeti'ne yazdığı bir dizi mektupta yayınladı. Çalışmaları mikrobiyoloji alanının temelini attı ve doğal dünyaya dair anlayışımız üzerinde derin bir etki yarattı.