Ancak, bazı kurak bölgeler var Endonezya'da düşük yağış ve seyrek bitki örtüsü ile karakterize edilir. Bu bölgeler çoğunlukla ülkenin doğu kesiminde bulunur , içermek:
* Timor :Timor adası, özellikle doğu kısmı, sınırlı yağışlı yarı kurak bir iklim yaşar.
* Sumba :Timor'a benzer şekilde Sumba, yarı kurak bir iklime sahip başka bir adadır.
* Flores :Flores adasında, özellikle batı ve kuzey bölgelerinde bazı kuru alanlara sahiptir.
* Nusa Tenggara Barat :Bu eyaletin bazı kısımları, özellikle doğu kıyısı, yarı kurak bir iklim yaşıyor.
Bu bölgeler Sahara veya Atacama gibi gerçek çöller değildir, ancak sınırlı yağış ve nispeten seyrek bitki örtüsü ile karakterizedir. Kuraklık esas olarak Doğu Adaları'ndaki Yüksek Dağlar tarafından oluşturulan yağmur gölgesi etkisine atfedilir.
Bu alanlar çöllere benzeyen özelliklere sahip olsa da, sınırlı ölçüde ve bazı bitki örtüsü ve su kaynaklarının varlığı nedeniyle büyük çöller olarak kabul edilmezler.