Plan, Cyrus'un güçlü Efsanevi Pokemon Cresselia ve Darkrai'nin gücünden yararlanmasıyla başlıyor. Cresselia'nın ay gücünü kontrol ettiği ve dilekleri gerçekleştirebildiği söylenirken, Darkrai karanlık ve kabuslarla ilişkilendirilir. Cyrus, yeteneklerini birleştirerek Distorsiyon Dünyası'nı yaratmayı ve gerçekliği değiştirmeyi planlıyor.
Planlarını harekete geçirmek için Galaktik İmparatorluk, Cresselia ve Darkrai'nin ikamet ettiği söylenen Sinnoh bölgesinin kontrolünü istiyor. Sinnoh'da çeşitli üsler kuruyorlar ve oyuncu karakterine ve ekibine karşı savaşlara giriyorlar. Dikkate değer saklanma yerlerinden biri, operasyonlarının ana merkezi olarak hizmet veren Veilstone City'deki Galaktik Karargâhtır.
Oyuncu oyunda ilerledikçe Galaktik İmparatorluğun üyeleriyle karşılaşır ve planlarını çözer. Doruk noktası, oyuncunun Cyrus'un Distortion World'ü yaratmaya çalıştığı Team Galactic'in gizli sığınağı Mızrak Sütunu'na ulaşmasıyla ortaya çıkar.
Oyuncu Galaktik Homurtulara, Komutanlara ve hatta Cyrus'a karşı zorlu savaşlarla yüzleşmelidir. Oyuncu, Cyrus'u yenmeyi başarırsa, planının tamamlanmasını engelleyebilir ve Sinnoh bölgesinde barışı yeniden sağlayabilir.
Pokemon Light Platinum'un ustaca planı, oyunun olay örgüsünü yönlendiren merkezi anlatı olarak hizmet ediyor ve savaşlar, bulmacalar ve Efsanevi Pokemon'la karşılaşmalarla dolu destansı bir maceraya zemin hazırlıyor.