Oyunun mekaniği, Shadow'un Kaos Enerjisini kullanma yeteneği etrafında döner ve ona Kaos Kontrolü ve Kaos Patlaması gibi özel saldırılar gerçekleştirmesine olanak tanır. Ayrıca Kaos Zümrütleri de toplayabilirsiniz Shadow'un yeteneklerini geliştiren ve ona özel dönüşümlere erişim sağlayan seviyeler boyunca dağılmış durumda.
Eğer bir Sonic oyununda silah kullanmayı düşünüyorsanız serinin farklı bir oyununu düşünüyor olabilirsiniz.