1. Yedi Kaos Zümrütünü toplayın: Bunlar oyunun seviyelerine dağılmış durumda ve son savaşa ulaşmak için hepsine ihtiyacınız var.
2. Oyunun sonunda Dark Gaia'yla yüzleşin: Yedi Kaos Zümrütünün tamamını topladıktan sonra, devasa, çok başlı bir canavar olan Dark Gaia'nın gerçek haliyle karşılaşacaksınız.
3. Kaos Zümrütlerinin gücünü kullanın: Dark Gaia'yı arındırmak için Zümrütlerin birleşik gücünü kullanacaksınız. Bu, yedi Kaos Zümrütünün tamamının toplanmasıyla açılan "Süper Sonik" formunun kullanılmasını içerir.
4. Arıtma işlemini gerçekleştirin: Super Sonic formundayken Dark Gaia'ya güçlü bir saldırı gerçekleştireceksiniz. Bu saldırı Dark Gaia'yı öldürmez, bunun yerine onu arındırır, dünyanın dengesini yeniden sağlar ve orijinal formuna geri döndürür.
Oyunun hikayesi restorasyon fikrine odaklanıyor doğrudan öldürmek yerine. Dark Gaia, her ne kadar yıkıcı olsa da sonuçta dünya dengesinin bir parçası ve amaç onu hak ettiği yere geri döndürmek.