Manga ve anime arasındaki temel farklardan bazıları şunlardır:
* Olayların sırası farklı. Mangada bazı olaylar animeye göre daha erken veya daha geç gerçekleşir. Örneğin mangada Teito Klein ilk bölümde Frau ile tanışırken animede 8. bölüme kadar tanışmıyorlar.
* Bazı karakterler farklıdır. Mangada animede yer almayan bazı karakterler olduğu gibi animede yer alan bazı karakterler de mangada yer almamaktadır. Mesela Ceres karakteri mangada yer almazken Mikage karakteri animede yer almıyor.
* Sonu farklı. Manga ve animenin farklı sonları var. Mangada Teito Klein ve Frau'nun yolculuğu animeden farklı bir şekilde sonuçlanıyor.
Genel olarak 07-Ghost mangası ve animesi aynı hikayenin iki farklı ve ayrı yorumudur. İki versiyon arasında bazı benzerlikler olsa da birçok farklılık da var.