1. Super Junior-K.R.Y.:Bu alt grup üç üyeden oluşur:Kyuhyun, Ryeowook ve Yesung. Duygulu balladları ve güçlü vokalleriyle tanınırlar.
2. Super Junior-T:Bu alt grup Tayland'da tanıtım yapıyor ve Leeteuk, Heechul, Shindong, Sungmin ve Eunhyuk üyelerinden oluşuyor. Hem Tayca hem de Korece şarkılar seslendiriyorlar.
3. Super Junior-M:Bu alt grup öncelikle Çin'de aktiftir ve Hangeng (eski üye), Siwon, Donghae, Ryeowook, Kyuhyun ve Zhou Mi üyelerinden oluşur. Mandarin Çincesi şarkılar söylüyorlar.
4. Super Junior-H:Bu alt grup süratli müzikleriyle tanınır. Leeteuk, Yesung, Kangin, Shindong, Sungmin ve Eunhyuk üyelerinden oluşur. Trot, hızlı temposu ve hareketli ritimleriyle karakterize edilen geleneksel bir Kore müzik türüdür.
5. Super Junior-D&E:Bu ikili Donghae ve Eunhyuk üyelerinden oluşuyor. Akılda kalıcı elektronik dans müzikleri ve enerjik performanslarıyla tanınırlar.
6. Super Junior-Happy:Bu alt grup parlak ve neşeli müziğiyle karakterizedir. Yesung, Shindong, Sungmin ve Leeteuk üyelerinden oluşur.
Bu alt gruplar, Super Junior'ın çeşitli müzik tarzlarını ve konseptlerini keşfetmesine ve aynı zamanda farklı üyelerin yeteneklerini ve güçlü yönlerini sergilemesine olanak tanır.