Ancak en belirgin ve merkezi düşman Loki'dir Thor'un üvey kardeşi ve filmdeki çatışmanın ana itici gücü. Gezegeni fethetmeye ve yönetmeye çalışarak Dünya'nın işgalini yönetiyor.
Chitauri gibi diğer düşmanlar ise (uzaylı bir ordu) ve HYDRA'nın ajanları Filmde önemli roller oynayan Loki, itici güç ve Yenilmezler'le doğrudan yüzleşen ana düşman olmaya devam ediyor.