* Görünüşe göre yargılamanın tehlikeleri: Hikaye, ilk izlenimlerle ne kadar kolay yanıltılabileceğimizi vurguluyor. Okuyucu da tıpkı polis gibi, kaba görünümünden ve babasıyla tartıştığından dolayı başlangıçta masum Charles McCarthy'den şüpheleniyor.
* Hakikat ve adaleti aramanın önemi: Hikaye, ne kadar rahatsız edici veya uygunsuz olursa olsun, yüzeysel yargıların ötesine bakma ve gerçeği keşfetme ihtiyacını vurguluyor. Holmes'un metodik soruşturması gerçek suçluyu ortaya çıkararak adaletin varsayımlarla sağlanamayacağını gösterir.
* Açgözlülük ve bencilliğin sonuçları: Hikaye, kontrolsüz açgözlülük ve bencilliğin nasıl yıkıcı sonuçlara yol açabileceğini gösteriyor. Miras arzusunun yol açtığı cinayet, açgözlülüğün yıkıcı gücünün altını çiziyor.
* İnsan ilişkilerinin kırılganlığı: Hikaye, babalar ve oğullar arasındaki karmaşık ve çoğu zaman gergin ilişkileri araştırıyor. Charles ile babası arasında trajediyle sonuçlanan gerilim, aile bağlarının kırılganlığını gösterir.
* Eleştirel düşünme ve gözlemin önemi: Holmes'un gizemi çözmedeki başarısı, ayrıntıları titizlikle gözlemleme ve kanıtları analiz etme yeteneğinde yatıyor. Okuyucuyu eleştirel düşünmeye ve görünüşleri göründüğü gibi kabul etmemeye teşvik ediyor.
Sonuçta Boscombe Vadisi Gizemi, görünüşlerin aldatıcı olabileceğini ve gerçek adaletin dikkatli bir soruşturma ve varsayımları sorgulama isteği gerektirdiğini hatırlatıyor. Rahatsız edici olsa bile gerçeği ve adaleti aramanın önemini ve açgözlülük ve bencilliğin muhakeme yeteneğimizi gölgelemesine izin vermenin sonuçlarını vurguluyor.