Antik çağlarda sezaryen doğumun yapılmış olabileceğini gösteren bazı kanıtlar vardır. Örneğin, antik Yunan doktoru Hipokrat, "embriyotomi" adı verilen ve bir bebeği çıkarmak için rahmin kesilerek açılmasını içeren bir prosedür hakkında yazmıştı. Ancak embriyotominin gerçekten yapılıp yapılmadığı belli değil ve Hipokrat'ın sadece spekülasyon yapması mümkün.
Başarılı bir sezaryen doğumunun belgelenen ilk vakası 1500 yılında Jacob Nufer adlı İsviçreli bir doktor tarafından gerçekleştirildi. Nufer'in hastası, rahim yırtılması adı verilen bir durumdan muzdarip olan Elisabeth Strüb adında bir kadındı. Nufer, bebeği Strüb'ün rahminden başarıyla çıkardı ve hem anne hem de çocuk hayatta kaldı.
Nufer'in zamanından bu yana geçen yüzyıllarda sezaryen doğum giderek yaygınlaştı. Bugün Amerika Birleşik Devletleri'ndeki tüm doğumların yaklaşık %30'unda sezaryen gerçekleştirilmektedir.