Televizyon:
* Kötü Davranan Erkekler (1992-1998): Bu durum komedisi, büyüleyici ve şanssız Gary'yi canlandırarak Clunes'ı ana akım başarıya taşıdı.
* Doc Martin (2004-günümüz): Belki de Clunes'un en ikonik rolü, Cornish kasabası Portwenn'de huysuz ama sevimli doktoru canlandırmasıdır.
* Reggie Perrin (2007-2009): Klasik İngiliz sitcomu "Reggie Perrin'in Yükselişi ve Düşüşü"nün yeniden yapımı.
* Büyük Kaçış (2003): Clunes'un Roger Bushell'i canlandırdığı iki bölümlük bir mini dizi.
* Jonathan Creek (2000-2016): Bu gizemli dizinin birkaç bölümünde ana karakterin en iyi arkadaşı, Maddy'nin kocası olarak göründü.
* Komutan (1998-2000): Kraliyet Donanması subayı Komutan Jack Harper'ın başrolünü oynadı.
* William ve Mary (2003-2010): Tekrar eden bir karakter olarak ortaya çıktı, ana karakterin kayınbiraderi.
* Saray (2008): Bu hiciv komedi dizisinde Kraliyet Ailesi'nin bir üyesinin rolünü oynadı.
* İnsan Avı (2019): Levi Bellfield'ın yakalanmasını konu alan bu gerçek suç dizisinde DCI Colin Sutton'ı canlandırdı.
* Kraliçenin Burnu (2001): Bu çocuk dizisinde konuşan köpek "Kraliçenin Burnu" karakterini seslendirdi.
Filmler:
* Kalp Atışı (1992): Clunes, popüler ITV dizisinin film versiyonunda rol aldı.
* Göller (2000): Clunes'un bir kadına takıntılı bir adamı canlandırdığı romantik bir gerilim.
* Zaman Makinesi (2002): Geleceğe seyahat eden bilim adamı Alexander Hartdegen rolünü oynadı.
* Son Dedektif (2003): Yazar Michael Connelly'nin bir dizi romanından uyarlanan bir polisiye gerilim filmi.
* Üç ve Dışarı (2011): Clunes'un yaşlanan bir futbolcuyu canlandırdığı kara komedi filmi.
* Barney Thomson Efsanesi (2015): Clunes'un kazara seri katile dönüşen bir berberi canlandırdığı kara komedi.
* Süper Bob (2015): Süper kahraman olmaya zorlanan yumuşak huylu bir adamı canlandırdı.
Bu kapsamlı bir liste olmasa da en dikkate değer ve tanınmış projelerinden bazılarını içermektedir.