Monsters University'nin konusu şu şekilde:
James P. "Sully" Sullivan ve en yakın arkadaşı Michael "Mike" Wazowski, Canavarlar Üniversitesi'ne kabul edilir. Her ikisi de en korkutucu kardeşlik olan Roar Omega Roar'a (ROR) katılmak isterler, ancak yeterince korkutucu olmadıkları için reddedilirler. Uyumsuzlardan ve dışlanmışlardan oluşan bir kardeşlik olan Oozma Kappa'ya (OK) katılırlar. Sully ve Mike yakın arkadaş olurlar ve birlikte çalışmayı öğrenirler. Ayrıca korkutmanın hayattaki en önemli şey olmadığını da öğreniyorlar; dostluk ve takım çalışması daha önemlidir.