Casuslar birbirlerini alt etmeye çalışırken, casusluklarını şakacı bir komediye dönüştüren komik engellerle karşılaşırlar. Black Spy dev bir yo-yo'nun içinde kalırken White Spy kendisini bir grup plastik tavuk tarafından takip edilirken bulur. Adanın bitki örtüsü ve faunası da bu çılgınlığa katılıyor; konuşan papağanlar casusların her hareketiyle dalga geçiyor ve haylaz maymunlar casusların gizli planlarını çalıyor.
Artan kaosun ortasında, iki casus gizli bir yeraltı laboratuvarına rastlarlar ve burada sonsuz rekabetlerinin ardındaki beyni keşfederler:Profesör Wacko adında haylaz bir MAD bilim adamı. Wacko'nun Spy vs Spy görevlerini kendi eğlencesi için düzenlediği, casusların gölgeleri kovalamasını sağlamak için uzaktan kumandalı kılıklar ve hileli aletler kullandığı ortaya çıktı.
Mantığa ve mantığa meydan okuyan heyecan verici bir sahnede Black Spy ve White Spy, Profesör Wacko'ya karşı bir araya gelerek muhallebi turtalar, patlayan purolar ve dev bir lastik bant içeren çılgın bir savaşa giriyor. Sonunda, casuslar ve bilim adamı, kendilerini sersemleten ve tamamen yenilgiye uğratan karmaşık bir olay örgüsünün içinde bulurlar.
Spy vs Spy macerasında perde kapanırken ajanlar kendilerini kendi karargahlarında bulurlar ve son kaçışlarının sadece çılgın bir halüsinasyon olup olmadığını merak ederler. İmza niteliğindeki gülümsemeleriyle omuz silkiyorlar ve Spy vs Spy dünyasının her zaman tuhaf sürprizler ve öngörülemeyen gelişmelerle dolu olacağını bilerek bir sonraki görevlerine hazırlanıyorlar.