iTunes'a aktarılan müzik:
> - Müzik dosyalarını iTunes arşivine eklerseniz ve bunları bilgisayarınızdaki klasörler (yönetilen iTunes arşivi) içinde düzenlerseniz, dosyaların doğrudan klasörden silinmesi, bunların iTunes'dan da kaldırılmasına neden olabilir. iTunes, iPhone'unuzla senkronize edildiğinde silinen bu dosyalar artık cihazda mevcut olmayacaktır.
Manuel olarak eklenen müzik:
> - Müzik dosyalarını iTunes dışındaki bir klasöre (yönetilmeyen iTunes arşivi) manuel olarak kopyalarsanız, iTunes'un kendi içinde belirli eylemler gerçekleştirmediğiniz sürece bu klasörde yapılan değişiklikler iTunes'a önceden eklenmiş olan öğeleri etkilemeyebilir. Ancak iPhone'unuzla eşzamanlarken iTunes'dan kaldırdığınız müzikler bir sonraki eşitleme sırasında cihazdan silinecektir.
Bu nedenle, hem iTunes'dan hem de iPhone'unuzdan müziği kalıcı olarak kaldırmak ve kopyalanmayı önlemek istiyorsanız, dosyaları doğrudan iTunes arşivinden silmek genellikle daha iyidir. Bu, şarkıları seçip dosya menüsünden "Sil" seçeneğini seçerek yapılabilir.