Juanes'in ayrıca Gibson ve Fender gitarlarının yanı sıra çeşitli luthier'lerin özel yapım enstrümanlarını kullandığı da biliniyor.
İşte Juanes'in kullandığı bilinen gitarlardan bazıları:
* Martin D-28:Bu Juanes'in ana akustik gitarıdır ve onu çok sayıda kayıt ve performansta kullanmıştır. D-28, masif Sitka ladin üst kısmı ve maun arka ve yan kısımlarına sahip, dretnot tarzı bir gitardır. Sıcak, dolgun sesiyle tanınır.
* Martin D-45:Bu, D-28'in daha pahalı ve sınırlı sayıda üretilen bir versiyonudur; üst kısmı masif Adirondack ladin ağacından, arka ve yan kısımları gül ağacından yapılmıştır.
* Martin OM-28:Bu, D-28 ve D-45'ten daha küçük gövdeli, daha hassas bir sese sahip bir gitardır. Parmakla çalmak ve tıngırdatmak için çok uygundur.
* Gibson J-45:Bu, masif Sitka ladin üst kısmı ve maun arka ve yan kısımlarına sahip, Gibson'un klasik bir akustik gitarıdır. J-45, ritim çalmak için mükemmel olan sıcak, vurucu bir sese sahiptir.
* Fender Stratocaster:Bu, Fender'in sağlam kızılağaç gövdesi, akçaağaç sapı ve üç tek bobinli manyetiği olan klasik bir elektro gitarıdır. Stratocaster parlak, tiz sesiyle tanınır.
Juanes çok yetenekli bir gitarist ve gitarlarından çok çeşitli sesler alabiliyor. Kendisi hem akustik hem de elektro gitarda ustadır ve aynı derecede rahat bir şekilde lead ve ritim çalabilmektedir.