Şarkı, hayatın güzelliğine dair bir merak ve takdir duygusu uyandıran "Yıldızlara bakın, sizin için nasıl parladıklarına bakın / Ve yaptığınız her şeye bakın" sözleriyle başlıyor. Ancak şarkıcı zamanın geçişini düşünürken ruh hali hızla melankoliye dönüşüyor:"Saat işliyor, işliyor / Ve güneş batıyor ve gece yaklaşıyor."
Koro, geçmişe duyulan özlemi ve değerli anlara tutunma arzusunu ifade ediyor:"Yanıyormuşum gibi hissediyorum, her şey yanıyor / Kalkmak, dışarı çıkmak, eve gitmek istiyorum / Orası her neyse." Şarkıcı, zamanın amansız ilerlemesinden kaçmayı ve daha basit, daha mutlu bir zamana dönmeyi arzuluyor.
İkinci ayet hayatta anlam arayışı temasını ele alıyor:"Bulamadığım bir şeyi arıyorum / Ve bulabildiğim her şeye tutunuyorum / Dağın zirvesine ulaşmak için, zirveye ulaş dağ / Ve denizde boğuluyormuşum gibi hissediyorum." Şarkıcı kendini kaybolmuş ve başıboş hissediyor, bunaltıcı ve belirsiz görünen bir dünyada çaresizce tutunacak bir şey arıyor.
Köprü, şarkıcının başkalarıyla bağlantı kurma ve onların varlığında teselli bulma arzusunu ifade etmesiyle bir umut ışığı sunuyor:"Seni burada istiyorum, yakınımda istiyorum / Şimdi kollarımı sana sarmak istiyorum." Bu, insani bağlantıya duyulan özlemi ve hayatın zorlukları karşısında destek ve arkadaşlığa duyulan ihtiyacı ortaya koyuyor.
Şarkı, açılış dizelerini tekrarlayan, ancak yeni keşfedilen bir kabullenme ve anlayış duygusuyla tekrarlanan "Yıldızlara bakın, bakın sizin için nasıl parlıyorlar" nakaratıyla sona eriyor. Şarkıcı, gece gökyüzünün güzelliğinde ve yıldızların kalıcı varlığında rahatlık bularak zamanın geçişi ve yaşamın geçiciliğiyle yüzleşmiş gibi görünüyor.
Genel olarak, "Clocks" evrensel insani kayıp, özlem ve yaşamdaki anlam arayışı deneyimlerini anlatan dokunaklı ve yansıtıcı bir şarkıdır. Varoluşun acısını ve tatlılığını yakalıyor, geçen zamanın acısını ve pişmanlığını kabul ederken aynı zamanda yaşam yolculuğunun güzelliğini ve harikasını da kutluyor.