* 1567: Kocası Lord Darnley'in ölümü ve Bothwell Kontu ile evlenmesinin ardından Mary, İskoç tahtından feragat etmeye zorlandı ve Lochleven Kalesi'nde hapsedildi .
* 1568: Lochleven Kalesi'nden kaçtı, ancak Langside Savaşı'nda mağlup oldu ve İngiltere'ye kaçtı ve orada hayatının geri kalanını hapiste geçirdi. Başlangıçta Carlisle Kalesi'nde tutuldu.
* 1568-1572: Bolton Kalesi'ne ve ardından Sheffield Kalesi'ne taşındı.
* 1572-1587: Mary, Tutbury Kalesi'ne, Wingfield Malikanesi'ne, Coventry'ye, Chatsworth Evi'ne ve son olarak da 1587'de yargılanıp idam edildiği Fotheringhay Kalesi'ne taşındı.
Her zaman zorlu koşullarda tutulmadığını belirtmek önemlidir. Yere ve siyasi iklime bağlı olarak bazı tutukluluk durumları diğerlerinden daha rahattı. Ancak her zaman sıkı bir koruma altındaydı ve hiçbir zaman özgürlüğüne kavuşamadı.