Arttırıcılar:Bunlar, transkripsiyon faktörlerini bağlayan ve yakındaki genlerin transkripsiyonunu destekleyen DNA dizileridir. Örneğin, immünoglobulin ağır zincir lokusundaki güçlendirici, bu genlerin B hücrelerinde yüksek düzeyde ekspresyonundan sorumludur.
Promotörler:Bunlar, RNA polimerazı bağlayan ve genlerin transkripsiyonunu başlatan DNA dizileridir. Örneğin insan büyüme hormonu genindeki promoter, bu genin hipofiz bezindeki ifadesinden sorumludur.
Susturucular:Bunlar, transkripsiyon faktörlerini bağlayan ve yakındaki genlerin transkripsiyonunu baskılayan DNA dizileridir. Örneğin insan β-globin genindeki susturucu, bu genin eritroid olmayan hücrelerde baskılanmasından sorumludur.
Trans-etkili diziler:
Transkripsiyon faktörleri:Bunlar cis-etkili dizilere bağlanan ve genlerin transkripsiyonunu düzenleyen proteinlerdir. Örneğin, transkripsiyon faktörü Oct-1, immünoglobulin ağır zincir güçlendiricideki oktamer motifine bağlanır ve bu genlerin B hücrelerinde transkripsiyonunu destekler.
RNA polimeraz:Bu, promotörlere bağlanan ve genleri RNA'ya kopyalayan bir protein kompleksidir.
Diğer düzenleyici proteinler:Bunlar cis-etkili dizilere bağlanan ve genlerin transkripsiyonunu çeşitli şekillerde düzenleyen proteinlerdir. Örneğin, CTCF proteini, insan β-globin genindeki CCCTC motifine bağlanarak, eritroid olmayan hücrelerde genin baskılanması için gerekli olan bu bölgenin kromatin yapısının düzenlenmesine yardımcı olur.