Fagot çift kamışlı bir nefesli çalgıdır, flüt ise bir deliğe hava üfleyerek çalınan bir nefesli çalgıdır. Fagot çalmak için gerekli olan ağızlık (dudak yerleşimi) ve hava akımı, flüt çalmak için gerekli olanlardan oldukça farklıdır, dolayısıyla flüt çalmayı öğrenmiş biri için fagot çalmayı öğrenmek hiç de kolay olmayacaktır. Aslında, fagotun genellikle öğrenilmesi flütten daha zorlayıcı bir enstrüman olduğu düşünüldüğünden, bu daha da zor olabilir.