2. Gizli bir üs konumu bulun. Sinnoh'ta birçok farklı gizli üs yeri var. En popüler konumlardan bazıları şunlardır:
* Route 218'deki küçük ada
* Route 213'te Kayıp Kule girişine yakın mağara
* Pastoria City'de yapım aşamasında olan ev
3. Gizli Temel Kitini kullanın. Gizli bir üs konumu bulduğunuzda, üssünüzü oluşturmak için Gizli Üs Kitini kullanın. Oluşturmak istediğiniz taban tipini seçebilir, ayrıca mobilya ve diğer eşyalarla da dekore edebilirsiniz.
4. Ekip üyelerini işe alın. Gizli üs ekibinize katılmaları için diğer oyuncuları işe alabilirsiniz. Bunu yapmak için işe almak istediğiniz kişiyle konuşun ve "Recruit" seçeneğini seçin.
5. Diğer takımlarla savaşın. Üssün girişindeki kişiyle konuşup "Savaş" seçeneğini seçerek diğer takımların gizli üsleriyle savaşabilirsiniz. Gizli üs savaşları 2'ye 2 savaşlardır ve kazanan, her iki rakibinin Pokemon'unu da deviren ilk takım olur.
6. Puanlar ve ödüller kazanın. Gizli üs savaşlarını kazanarak ve gizli üs görevlerini tamamlayarak puan kazanabilirsiniz. Puanlarınızı Gizli Üs Mağazasından öğeler satın almak için kullanabileceğiniz gibi, bunları gizli üssünüzü yükseltmek için de kullanabilirsiniz.