1. Hükümet Komplosu :Bourne aslında "David Webb" olarak bilinen yüksek eğitimli bir CIA suikastçısıydı. Ancak hileli bir operasyonun ters gitmesinin ardından hafıza kaybı yaşadı ve geçmişine dair hiçbir anı olmayan bir sivile dönüştü. CIA ve diğer devlet kurumları, Bourne'u ve onun gibi diğer suikastçıları yaratan gizli bir kara operasyon projesi olan Treadstone programının sırlarını örtbas etmek için onu ortadan kaldırmaya çalışıyor.
2. Karabriar :Blackbriar, eski CIA yetkilileri tarafından kurulan Treadstone'un devamı niteliğindeki bir organizasyondur. Bourne'u kontrol etmek ve onun becerilerini kendi gizli operasyonları için kullanmak istiyorlar. Ancak Bourne, bağımsız yapısı ve faaliyetlerini ifşa etme riski nedeniyle planları için bir tehdit haline gelir.
3. Kirill ve Rus Hükümeti :Bazı durumlarda Bourne'un eylemleri Rus hükümetinin, özellikle de Kirill karakterinin çıkarlarıyla çatışıyor. Kirill, sevdiklerinin ölümüyle sonuçlanan geçmiş eylemleri nedeniyle Bourne'dan intikam almak isteyen üst düzey bir Rus istihbarat subayıdır. Bourne'u kişisel bir düşman olarak görüyor ve onu ortadan kaldırmaya çalışıyor.
4. Kişisel Düşmanlık :Bourne, geçmişiyle ilgili gerçekleri ve etrafındaki komploları ortaya çıkardıkça kendisine karşı kişisel bir kin besleyen kişilerle karşılaşır. Bu kişiler, Bourne'un eylemleri nedeniyle ihanete uğradığını veya haksızlığa uğradığını hisseden ve onları intikam almaya motive eden eski meslektaşları veya düşmanları olabilir.
Bourne'u öldürmek istemenin nedenlerinin, Bourne serisi kitaplarının veya filmlerinin belirli olay örgüsüne bağlı olarak değiştiğini ve bu nedenlerin tamamının her hikayede mevcut olmayabileceğini unutmamak önemlidir.